DOI:

Опис-посилання

ISSN 1812-7231 Klin.inform.telemed. Volume 4, Issue 5, 2008, Pages 41-49

Автор(и)

С. В. Горобець, О. Ю. Горобець, Д. О. Дереча

Установа(ви)

Національний технічний університет України "Київський політехнічний інститут"

Назва статті

Біоінформатика як основний інструмент нанобіотехнології та наномедицини

Анотація (резюме)

В даній роботі розглянуто основні досягнення та сфери застосування біоінформаційних технологій. Вказано на перспективи їх розвитку у взаємозв'язку з суміжними областями знань, такими як нанобіотехнологія, наномедицина та інші.

Ключові слова

біоінформатика, геном, база даних, ДНК, нанобіотехнологія

Список літератури

1. Salata O. V. Application of nanopracticles in biology and medicine. Journal of nanobiotechnology. 2004, P. 95–101.

2. Арчаков А. И. Геномика, протеомика и биоинформатика — науки XXI столетия. Фармацевтический вестник, №9 (208), 13 марта 2001 г.

3. Арчаков А. И., Геномика, протеомика, биоинформатика. Медицинская газета № 26, 11 апреля 2001 г.

4. Свердлов Е. Д. Фрэнсис Крик в его прогнозе на 2000 год был почти абсолютно прав. Биоорганическая химия том 26, N 10, 2000, C. 761–766.

5. Шабарова З. А., Богданов А. А. Химия нуклеиновых кислот и их компонентов. М., Химия, 1978.

6. Баранов В. Медицина на пороге революции (url) http://nauka.relis.ru/08/0009/08009008.htm

7. Арчаков А. И., Поройков В. В., Белкина Н. В., Гусев С. А., Дубанов А. В., Иванов А. С., Лагунин А. А., Лисица А. В., Скворцов В. С., Соболев Б. Н. Новые технологии в биомедицине. Биоинформатика. (url) http://www.mirrebenka.h10.ru/genomics.htm

8. Мисюров Д. Нано-биотехнологические исследования находят применение в медицине. В мире науки, № 8, 2005.

9. I. Safarik, M. Safarikova, Magnetic nanoparticles and biosciences. Monatshefte fur Chemie, 2002, P. 737–759.

10. A. Mehta, M. Rief, and et al. Singlemolecule biomechanics with optical methods, Science, vol. 283, 1999, P. 1689–1695.

11. Mahtab R., Rojers J. P., Mnrphy C. J. Protein sized quantum dot can distinguish between "straight", "bent" and "kink oligonucleotides". J. Am. Soc. 1995, P. 9099–9100.

12. Cote R., D. Rothwell, J. Palotay, R. Beckett and L. Brochu, Eds. SNOMED International: The Systematized Nomenclature of Human and Veterinary Medicine. Northfield, IL, College of American Pathologists, 1993.

13. Molday R. S., MacCenzie D. Immunospecific ferromagnetic iron dextran reagents for the labeling and magnetic separation of cells. J. Immunol Maethods, 1982, P. 353–367.

14. Ma J., Wong H., Kong L. B. Peng K. W. Biometric processing of nanocrystallite bioactive apatite coating on titanium. Nanotechnology, 2003, P. 619–623.

15. de la Isla A., Brostow W., Bujard B., Estevez M. et all Nanohybryd scratch resistant coating for teethand bone viscoelasticity manifested in tribiology. Mat Resr Innovat 2003, P. 110–114.

16. G. V. Shivashankar and A. Libchaber Single DNA molecule grafting and manipulation using a combined atomic force microscope and an optical tweezer, Appl. Phys. Lett., vol. 71, 1997, P. 27–3729.

17. Sahoo K. S. and Labhasetwar V. Nanotech Approaches to Drug Delivery and Imaging, DDT vol. 8, 2003, P. 1112–1120.

18. Гельфанд М. С., Миронов А. А. Вычислительная биология на рубеже десятилетий. Молекулярная биология. 1999, C. 969–984.

19. Экспериментальные методы исследования белков и нуклеиновых кислот. Под ред. М. А. Прокофьева. М., Изд-во МГУ, 1985.

20. М. С. Гельфанд, В. А. Любецки. Биоинформатика от эксперимента к компьютерному анализу и снова к эксперименту. Вестник РАН, том 73, № 11, 2003 C. 987–994.

21. Koonin E. V., Galperin M. Y. Sequence-Evolution-Function: Computational approachers in comparative genomics. Kluwer Academic Press, 2003.

22. Bryan Bergeron Bioinformatics Computing. Prentice Hall PTR, 2002, 439p.

23. Balas, E., S. Boren and G. Brown, Eds. Information Technology Strategies from the United States and the European Union. Amsterdam, IOS Press, 2000.

24. Altschul, S., M. Boguski, W. Gish and J. Wootton. Issues in Searching Molecular Sequence Databases. Nature Genetics 1994, P. 119–129.

25. Jagota A., Data Analysis and Classification for Bioinformatics. Santa Cruz, CA, Arun Jagota, 2000.

26. Mack, R., Y. Ravin and R. Byrd. Knowledge Portals and the Emerging Digital Knowledge Workplace. IBM Systems Journal 2001, P. 814–830.

27. Объединенный центр вычислительной биологии и биоинформатики. Институт математических проблем биологии РАН. (url) http://www.jcbi.ru

28. Арчаков А. И., Поройков В. В., Белкина Н. В., Гусев С. А., Дубанов А. В., Иванов А. С., Лагунин А. А., Лисица А. В., Скворцов В. С., Соболев Б. Н. Новые технологии в биомедицине. Биоинформатика. (url) http://www.mirrebenka.h10.ru/genomics.htm

29. (url) http://severin.ru/laboratories/petrosyan_grp.php 2004

30. Celko, J. Data & Databases: Concepts in Practice. San Francisco, CA, Morgan-Kaufmann, 1999.

31. Binstock, A. and J. Rex. Practical Algorithms for Programmers. New York, Addison-Wesley, 1995.

32. Benson, D., I. Karsch-Mizrachi, D. Lipman, J. Ostell, B. Rapp and D. Wheeler. "GenBank". Nucleic Acids Research, 2000, P 15–18.

33. Александров А. А., Александров Н. Н., Бородовский М. Ю. и др. Компьютерный анализ генетических текстов. М. Наука, 2002.

34. Bergeron, B. and R. Rouse. Cognitive Aspects of Modeling and Simulating Complex Biological Systems. Structuring Biological Systems: A Computer Modeling Approach (S. Iyengar, Ed.). Boca Raton, FL, CRC Press, 1992, P. 125–166.

35. Marti-Renom, M., A. Struart, A. Fiser, R. Sanchez, F. Melo and A. Sali. Comparative Protein Structure Modeling of Genes and Genomes. Annual Review of Biophysics and Biomolecular Structure, 2000, P. 291–325.

36. (url) http://compaq.com.

37. (url) http://www.celera.com.

38. Sahoo K. S. and Labhasetwar V. Nanotech Approaches to Drug Delivery and Imaging, DDT vol. 8, no. 24, 2003, P. 1112–1120.

39. (url) http://nutec.com.

40. (url) http://www.ibm.com.

41. D. Bakewell, M. Hughes, J. Milner, and H. Morgan, Dielectrophoretic manipulation of Avidin and DNA, Proc of the Int. Conf. of the IEEE Eng. In Medicine and Biology Soc., vol. 20, N. 2, 1998, P. 1079–1082.

43. Banatao R. Visualization. Bioinformatics Methods and Techniques. Stanford University, Stanford Center for Professional Development, 2002.

44. Baxevanis, A. and B. Ouellette, Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. New York, John Wiley & Sons, 2001.

45. Jagota, A. Data Analysis and Classification for Bioinformatics. Santa Cruz, CA, Arun Jagota, 2000.

46. Garfinkel S. Database Nation. Sebastopol, CA, O'Reilly & Associates, 1997.

47. Ratledge C. and Kristiansen B. Eds. Basic Biotechnology. New York, Cambridge University Press, 2001.

48. Smith D. Java for the World Wide Web. Berkley, CA, Peachpit Press, 1998.

49. Agarwal P. and States D. Comparative Accuracy of Methods for Protein Similarity Search. Bioinformatics, 1988, P. 40–47.

50. Altschul, S., M. Boguski, W. Gish and J. Wootton. Issues in Searching Molecular Sequence Databases. Nature Genetics, 1994, P. 119–129.

51. Binstock A. and Rex J. Practical Algorithms for Programmers. New York, Addison-Wesley, 1995.

52. Cote, R., D. Rothwell, J. Palotay, R. Beckett and L. Brochu, Eds. SNOMED International, The Systematized Nomenclature of Human and Veterinary Medicine. Northfield, IL, College of American Pathologists, 1993.

53. Van Ginneken, A. The Structure of Data in Medical Records. Yearbook of Medical Informatics (J. Van Bemmel and A. McCay, Eds.). Stuttgart, Germany, Schattauer, 1995, P. 61–70.

54. Altman R. Pairwise & Multiple Sequence Alignment, Bioinformatics Methods and Techniques. Stanford University, Stanford Center for Professional Development, 2002.

55. Altschul, S., W. Gish, W. Miller, E. Myers and D. Lipman. Basic Local Alignment Search Tool. Journal of Molecular Biology, N 215, 1990, P. 403–410.

56. Apostolico, A. and R. Giancarlo. Sequence Alignment in Molecular Biology. Journal of Computational Biology, N 5, 1998, P. 173–196.

57. Cheng B. Protein Structure Analysis. Bioinformatics Methods and Techniques. Stanford University, Stanford Center for Professional Development, 2002.

58. Eddy S. Hidden Markov Models. Current Opinion in Structural Biology, N 6, 1996, P. 361–365.

59. Schuler G. Sequence Alignment and Database Searching. Meth Biochem Anal, N 39, 1998, P. 145–71.

60. Thompson, J., F. Plewniak and O. Poch. A Comprehensive Comparison of Multiple Sequence Alignment Programs. Nucleic Acids Research, vol. 27, 1999, P. 2682–2690.

61. Попов Е. М. Успехи химии, T 64, 1995, C. 143–1182.

62. Зоркий П. М., Зоркая О. Н. Ординарная органическая кристаллохимия. Журн. структур. химии, Т39, №1, 1998, C.126–151.

63. Зоркий П. М. Структура органического кристалла. Соросовский образовательный журнал Т7, №11, 2001, C. 53–58.

64. Лахно В. Д. Биоинформатика и высокопроизводительные вычисления. Вестн. РФФИ, 2000, с. 38–45.

65. Копылов А. М. Рентгеноструктурный анализ рибосом – статика динамики Биохимия. 2002. т. 67, вып.3. с. 449–460.

66. Копылов А. М. Рентгеноструктурный анализ РНК – белковых комплексов. Биохимия, т. 61., 1996, с. 1911–1916.

67. Лунин В. Ю. Рентгеноструктурный анализ белков: пробл. расшифровки структуры. Докл. на III всесоюз. совещ. "Математические методы для исследования полимеров", (Пущино, 2123 июня 1983г.) Препринт Пущино, 1983, 19с.

68. Никифоров В. Г. Структурно-функциональные исследования РНК-полимеры (1962-2001) Молекулярная биология, 2002, с. 167–207.

69. Компьютеры и суперкомпьютеры в биологии Под. ред. В. Д. Лахно и М. Н. Устинина Москва–Ижевск Институт компьютерных исследований, 2002, 528 с.

Повнотекстова версія http://kit-journal.com.ua/uk/viewer_uk.html?doc/2008_5/10.pdf